Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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