Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms