Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EEA1Q15075 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EEA1Q15075 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms