Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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