Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms