Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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