Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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