Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms