Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX2Q13950 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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