Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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ITGA9Q13797 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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