Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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