Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 478.2 ms