Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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