Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms