Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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GPS1Q13098 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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GPS1Q13098 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms