Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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