Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM32Q13049 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM32Q13049 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms