Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FOXI1Q12951 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXI1Q12951 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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