Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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