Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHX9Q08211 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms