Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms