Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX4Q06945 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms