Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms