Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms