Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms