Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAP1Q01518 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms