Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTCQ00610 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms