Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms