Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2C1P98194 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms