Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RAB4BP61018 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RAB4BP61018 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RAB4BP61018 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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