Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms