Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms