Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP107P57740 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms