Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms