Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms