Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms