Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ETV1P50549 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ETV1P50549 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ETV1P50549 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ETV1P50549 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms