Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms