Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP4P49662 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms