Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SLC4A3P48751 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A3P48751 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms