Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NESP48681 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NESP48681 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NESP48681 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NESP48681 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NESP48681 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NESP48681 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NESP48681 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NESP48681 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NESP48681 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NESP48681 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NESP48681 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NESP48681 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NESP48681 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NESP48681 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NESP48681 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NESP48681 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NESP48681 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NESP48681 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NESP48681 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NESP48681 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NESP48681 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NESP48681 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NESP48681 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
NESP48681 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
NESP48681 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NESP48681 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NESP48681 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NESP48681 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NESP48681 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NESP48681 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NESP48681 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NESP48681 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NESP48681 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NESP48681 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NESP48681 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NESP48681 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NESP48681 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NESP48681 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NESP48681 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NESP48681 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NESP48681 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NESP48681 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NESP48681 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NESP48681 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NESP48681 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NESP48681 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NESP48681 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NESP48681 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NESP48681 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NESP48681 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NESP48681 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NESP48681 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NESP48681 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms