Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms