Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRCC3P46736 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRCC3P46736 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRCC3P46736 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRCC3P46736 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRCC3P46736 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRCC3P46736 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRCC3P46736 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRCC3P46736 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRCC3P46736 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRCC3P46736 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRCC3P46736 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRCC3P46736 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms