Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC4P35249 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC4P35249 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC4P35249 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC4P35249 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC4P35249 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC4P35249 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC4P35249 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC4P35249 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC4P35249 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC4P35249 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC4P35249 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC4P35249 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFC4P35249 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFC4P35249 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC4P35249 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC4P35249 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms