Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms