Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA1P29973 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA1P29973 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA1P29973 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA1P29973 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA1P29973 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA1P29973 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGA1P29973 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms