Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms