Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms