Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms