Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO1P25800 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO1P25800 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO1P25800 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO1P25800 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO1P25800 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO1P25800 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO1P25800 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms